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15.5.12

Els Éssers Vius més senzills a 1ESOF

A classe,amb els alumnes de 1ESOF, dintre de la part teòrica vam estar estudiant els Éssers Vius més senzills, i que millor manera que intentar veure'n algun que altre en directe.

Doncs,ens vam posar "mans a l'obra" i els vam intentar buscar-los mitjançant el microscopi.

 A vegades es fa difícil veure'ls, i sobretot quan els alumnes encara no estan massa experimentats en anar "perseguint-los" amb el micro. Però afortunadament vam tindre sort, i vam poder gaudir de vorticel·les menjant a tope, i també vam veure algun que altre rotífer.

Crec que va ser una bona forma de concloure aquesta part de la Biologia, que sempre ens transporta a un "Món minúscul" però al mateix temps espectacular.
* Aquest post és còpia del que està posat a "Camp de Margarides"





10.5.09

"in vitro", "in vivo" y ahora "in silico"


Entre otros artículos interesantes, la revista Investigación y Ciencia (mayo) publica el artículo Nuevas tácticas contra la tuberculosis.
El artículo hace referencia a las estrategias farmacológicas de vanguardia derivadas de la secuenciación del genoma del Mycobacterium tuberculosis - Mtb - (1998) responsable de la enfermedad . El conocimiento del genoma de esta bacteria ha permitido conocer mejor su metabolismo e identificar nuevas dianas terapeúticas.
Los conocimientos acumulados desde 1998 sobre esta bacteria nos acercan cada vez más a la posibilidad de reproducir el Mtb "in silico", esto es, desarrollar una simulación virtual de la bacteria que reproduzca el comportamiento de la misma en el hospedador, esto permitiría identificar qué componentes bacterianos son las mejores dianas para los fármacos y qué fármaco operará mejor sobre esas dianas. Elaborar esas simulaciones (microbiología computacional) requerirá sin duda más estudios y un conocimento exhaustivo de todas y cada una de las vías bioquímicas del microorganismo y de las propiedades que puedan derivarse de su interacción con el hospedador (propiedades emergentes). Los estudios "in silico" complementarían los estudios "in vitro" e "in vivo", que son los que habitualmente se llevan a cabo, y sin duda aportarán nuevas alterantivas a la lucha contra la tuberculosis.
"Nunca hasta ahora ha sido tan apremiante la necesidad de disponer de pruebas diagnósticas , fármacos y vacunas antituberculosas. Queda mucho camino por recorrer, pero con la descodificación del genoma de Homo sapiens y Mycobacterium tuberculosis, y la dedicación de una falange de expertos, el impulso del cambio es imparable"

24.1.08

Rotífers

Continuant amb la línia d’observació dels microorganismes que anem trobant en l’aigua que ens porten els alumnes per a pràctiques de laboratori, ací us mostrem un video en el que vorem Rotífers.

La peculiaritat més significativa d’aquests animals és la presència d’una/unes corona/es formada per cilis que en moure’s creen un corrent en l’aigua que provoca que tot allò que està al voltant de l’animal siga capturat.

Hi ha bastant informació sobre Rotífers en la xarxa, però a continuació us deixe la que a mi almenys més m’ha agradat; dues adreces de webs en francés que estan molt bé, i una sèrie de videos que estan penjats a Youtube.

Com en l’anterior ocasió, si el nom que he posat als animals que apareixen al video no són correctes, o en altres que ixen, i no posat el nom, vosaltres el sabeu, ho podeu afegir amb algun comentari

* He penjat el video en Vimeo perquè crec que te més qualitat que Youtube, però Sergio em comenta que no el veu amb Fifefox. Per aquells que no el poden veure, en aquest hiperenllaç a Youtube el podeu veure també




Rotifers. from Rafa Mollà on Vimeo.

2.12.07

Río Tinto


Si las vistas de este río son sorprendentes, no lo son menos los resultados del estudio de este ecosistema singular, las características más extremas del río son dos:
  1. acidez del sistema, pH próximo a 2,
  2. elevada concentración de metales pesados, que son muy tóxicos, cobre, arsénico, cadmio y otros.
En contra de lo que cabría esperar por su historia reciente (explotación minera, vídeo1), la singularidad del Río Tinto no se debe exclusivamente a la actividad minera, desde el punto de vista paleontológico está demostrado que el Río Tinto es así desde hace por lo menos 300.000 años y quizá muchos más. (ver entrevista con Ricardo Amils)

Las sorpresas no terminan ahí; las condiciones extremas, invitaban a pensar que allí habría unos cuantos organismos muy bien adaptados al sistema y poco más; sin embargo, se han encontrado unos 1300 organismos diferentes, incluyendo arqueobacterias, levaduras, hongos y protistas; llama la atención que la biomasa más abundante en el río parecen ser algas.

La cuenca del río Tinto discurre por la franja pirítica Ibérica, una de las mayores formaciones de complejos sulfurosos del mundo. La pirita (el oro de los tontos) es sulfuro de hierro (FeS2). Tras una década de estudio, Ricardo Amils y sus colaboradores piensan que unas bacterias que viven en el río convierten estos sulfuros en ácido sulfúrico, lo que le da al río su bajo pH y otras oxidan el hierro, lo que le da su característico color rojo. Aunque los sulfuros y el hierro se oxidan naturalmente en contacto con el aire, las bacterias actúan de catalizador acelerando las reacciones en gran medida. (para saber más)

El descubrimiento de organismos capaces de desarrollarse en condiciones ambientales extremas, ha permitido, por un lado, demostrar que la vida es robusta y adaptable, y, por otro, ampliar el abanico de posibilidades de existencia de vida, no sólo en nuestro planeta sino en el Sistema Solar y en el Universo.

Pero las sorpresas siguen, Río Tinto es un ecosistema que tiene ciertas similitudes con lugares de Marte, de algún modo, Río Tinto es un ecosistema marciano en la Tierra.

Desde un punto de vista astrobiológico, acercarse al río Tinto es, tal vez, hacer un viaje hacia atrás en el tiempo sobre la superficie de Marte (....) Efectivamente, los modelos biológicos del río Tinto nos muestran una serie de comunidades de microorganismos habitando un entorno caracterizado por varias condiciones extremas para la vida como la conocemos, y que podrían haber sido comunes sobre la superficie de Marte hace miles de millones de años (....) las comunidades bacterianas halladas en el río Tinto han promovido la precipitación del hierro, mezclado con azufre y otros metales, creando un sustrato muy similar al suelo marciano y muy raro en la Tierra.

Pero ... ¿Puede haber vida en Marte?

27.11.07

Microorganismes: Vorticel·les

Al llarg d'aquestes setmanes estem treballant en les assignatures de Laboratori de Bio-Geo de 1r i 3r d'ESO amb el microscopi, i concretament observant els diferents microorganismes que es podem trobar a l'aigua.
Els alumnes han anat portant aigua de diferents punts com són sèquies, basses, tolls, etc. i el resultat està sent fantàstic. Ens estem trobant amb una "quadrilla" d'exemplars, que per una altra banda, alguns conec, però que d'altres, la veritat se m'escapen, i al màxim que apleguem és a situar-los en algun grup taxonòmic de nivell superior, i tampoc no sempre estem convençuts. Per això, si als textos que vaig posant als videos, o en els comentaris que puc fer, apareix alguna errada, per favor, no dubteu en escriure als comentaris, i així ajudar-nos a conèixer millor aquesta maravillosa microfauna i microflora que veiem.
En aquesta ocasió us presente un video de vorticel·les, un protozou molt bonic, i que per una altra banda és fàcil de gravar perquè no es mou massa.

24.11.07

El cólera en Valencia. Ferrán vs Cajal


En 1885 , la comunidad valenciana sufrió una epidemia de cólera histórica (ver Valencia y la epidemia de cólera de 1885, y Valencia queda sitiada por el cólera)

La epidemia de ese año produjo casi cinco mil muertes en Valencia (datos referidos a las epidemias de cólera del sigo XIX), casi todas ellas concentradas en la segunda quincena de junio y la primera de julio, en las que hubo días que fallecieron más de doscientas personas. Afectó también a otras trescientas cincuenta localidades valencianas, ocasionando cerca de treinta mil muertes.

En junio de 1884, la noticia de una primera víctima mortal de cólera en el puerto francés de Toulon provocó la alarma en Cataluña a causa de la proximidad geográfica de la infección. Poco después, al saberse que en Marsella se habían contabilitzado 3.500 victimas mortales al final del año, en Barcelona se adoptaron una serie de medidas preventivas. Estas medidas no consiguieron inmunizar completamente a la población, pero ayudaron a hacer frente al efecto de la enfermedad en la zona. Entre otras decisiones, se formó una comisión científica que se trasladó a Toulon y Marsella para estudiar la epidemia in situ. Uno de los médicos de la comisión fue Jaume Ferran i Clua, que desarrolló una vacuna preventiva utilizando una suspensión de bacterias responsables de la enfermedad vivas.

En 1885, ante la inminente amenza del cólera, el Gobernador de Valencia, aconsejado por las instituciones médicas solicitó la ayuda del doctor Ferrán que llegó a la ciudad el 4 de abril, instaló su laboratorio en Valencia, e inició la campaña de vacunación.

Sin embargo, la eficacia de la vacuna estaba por demostrar y no había pocos detractores de la vacuna de Ferrán, de hecho el tema desató una polémica a nivel nacional en foros científicos y políticos - "la cuestión Ferrán"-. Entre otros científicos y comisiones, también extrajeras, Santiago Ramón y Cajal elaboró un informe sobre el cólera y la eficacia de la vacuna de Ferrán a petición de la Diputación Provincial de Zaragoza (Estudios sobre el microbio vírgula del cólera y las inoculaciones profilácticas ), en este informe Santiago Ramón y Cajal, que entonces era catedrático de anatomía en la Universidad de Valencia, se mostró escéptico con el trabajo desarrollado por su colega.

En su laboratorio, Ramón y Cajal, reprodujo los trabajos experimentales de Ferrán y reafirmó la presencia del bacilo colérico en las heces de los enfermos. Después comprobó la vacuna y concluyó que la de gérmenes vivos (propuesta por Ferrán), producía no una enfermedad atenuada sino una enfermedad diferente (menos virulenta), originada por el bacilo al vivir fuera de su medio natural. Apuntó la posibilidad de que la inmunidad la produjera no el bacilo sino una sustancia que éste segregaría (poco se sabía sobre el funcionamiento del sistema inmunitario en aquel tiempo). Cajal proponía buscar la forma de fabricarla y utilizarla en vez de los bacilos vivos que eran muy peligrosos. La principal aportación de Ramón y Cajal en este estudio fue el demostrar la posibilidad de vacunar eficazmente empleando inoculaciones hipodérmicas de cultivos del vírgula muertos por el calor (una novedad en aquel momento); de esta forma, Cajal introducía por vez primera en la historia de la Medicina, el concepto de vacuna química al no emplear gérmenes vivos. Sin embargo, este hallazgo se le atribuiría a los bacteriólogos norteamericanos Salmon y Smith quienes la describieron un año más tarde, en 1886. Sobre sus hallazgos bacteriológicos comenta Cajal: «Excusado es decir que todas estas modestas contribuciones teórico-experimentales pasaron inadvertidas en los laboratorios de París y Berlín. Eran aquellos tiempos harto difíciles para los españoles aficionados a la investigación» . A su regreso a Valencia, en octubre de 1885, tentado estuvo Cajal de dedicarse a la bacteriología. Eran los años de los deslumbrantes logros en el conocimiento de las enfermedades infecciosas obtenidos por los microbiólogos franceses y alemanes dirigidos por Pasteur y Koch.(ver Contribución de Santiago Ramón y Cajal a la patología). A pesar de que dijo que la vacuna Ferrán era inócua y había que experimentarla más, Ramón y Cajal se mostró en contra de la misma, lo que dio a conocer en conferencias y publicaciones.

Las críticas realizadas al trabajo de Ferrán, sus enfrentamientos personales, los tejemanejes políticos, pero sobre todo su negativa a explicar el método de obtención de la vacuna, terminaron por animar al gobierno a prohibir la vacunación contra el cólera.

Pese a todo, años más tarde se reconocieron internacionalmente los méritos del doctor Ferrán en el estudio del cólera y en la elaboración de la primera vacuna anticolérica. Sin duda, Jaume Ferrán i Clua ha sido uno de los pilares de la microbiología de nuestro país, pero no hay que olvidar tampoco las aportaciones de Santiago Ramón y Cajal.

Los dos últimos brotes de cólera registrados en España se sitúan en 1971 y 1979. En la actualidad sólo se detectan casos importados aislados (fuente) pero sigue siendo un problema importante en el tercer mundo (fuente)

En una entrada anterior hicimos referencia al descubrimiento en 1854 del modo de propagación de la enfermedad y las primeras medidas profilácticas recomendadas por John Snow.

3.9.07

Colección de metabolismos en una botella

Ya no me acordaba de la columna de Winogradsky hasta que leí el artículo Manchas cromáticas o diversidad de microorganismos, publicado en Investigación y Ciencia de marzo de 2007. Nunca había visto la imagen de estas columnas y me sorprendio el colorido de las misma.


Desconozco la dificultad de desarrollar esta experiencia, por lo menos la parte de montar, observar, distinguir y ver la evolución de las diferentes poblaciones y obtener unas imágenes parecidas, en el contexto de un IES

Aparentemente el procedimiento es muy sencillo y no reviste demasiada dificultad, en la red he podido localizar algunos protocolos.

Me propongo ponerme manos a la obra, pero como estoy seguro que esto lo han hecho muchos colegas antes que yo, aunque sean muy pocos los lectores de este blog ....

¿Sabes algo sobre el tema?
¿Tienes alguna experiencia?
¿Algún truco? ¿Alguna recomendación?

19.1.07

Sobre Lynn Margulis

Hoy hemos hecho referencia a Lynn Margulis y la Teoría Endosimbionte en la clase de Biología de 2º Bachillerato. Hoy también, el periódico El País publica:

La bióloga Margulis defiende a las bacterias en la presentación de la versión en valenciano de su obra

Els inicis de la vida abunda en la cuestión de que durante la mayor parte de la historia de la Tierra, ésta estuvo poblada solamente por bacterias. Y que ellas se encargaron de modelar durante millones de años la superficie y la atmósfera del planeta. La obra describe el origen y la evolución de las procariotas, pero se centra en la aparición de las células con núcleo.

El pasado día 16 la Doctora Margulis desarrolló la conferencia Revolució en l'evolució en la Universidad Autónoma de Barcelona (el vídeo - puedes tener algún problema si usas FireFox)

En la página de podcast de los Museos Científicos Coruñeses podemos escuchar otra conferencia de Lynn Margulis, en este caso sobre foraminíferos titulada Arenas Vivas, incluyo el podcast.


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